E-mailcertifikatet bruges til at signere e-mail og Office-dokumenter. Signaturen giver sikkerhed om afsenderen og indholdet af filen.
E-mail kryptering
E-mail certifikatet kan bruges til at sende krypterede e-mails, som kun kan læses af den påtænkte modtager. Både afsender og modtager skal bruge deres egne certifikater til at give mulighed for e-mail kryptering. Signering og kryptering er kun mulig via e-mail software der understøtter S/MIME.
Sikkert login
E-mailcertifikatet kan også bruges som et klientcertifikat med mulighed for sikker login til online applikationer og tjenester. I så fald erstatter certifikatet den traditionelle adgangskode eller bruges som endnu et skridt i login-processen. Dette er kendt som to-faktor-autentificering. For ekstra sikkerhed, er det også muligt at gemme certifikatet på en PKI token.